Řídicí orgán
Na základě Usnesení vlády ČR č. 233/2021 je řídicím orgánem všech tří operačních programů fondů EU v oblasti vnitřních věcí Ministerstvo vnitra. Dle organizačního řádu ministerstva vnitra je pověřen výkonem funkce řídicího orgánu odbor fondů Evropské unie v oblasti vnitřních věcí. Tento odbor se člení na tři oddělení:
- Oddělení implementace programů
- Oddělení řízení programů
- Oddělení metodiky a kontroly